С момента возникновения Союза русского народа и по сей день в обществе существовали диаметрально противоположные взгляды на эту организацию. Монархисты, православные патриоты и простые консервативные граждане видели в ней оплот самодержавной идеи, выражение народной преданности к императору и идеи православной соборности. Среди революционно-настроенных россиян и либералов сложилось представление о Союзе как о реакционной, погромной и антисемитской организации, созданной правительством. Впоследствии эта точка зрения была принята и в советской историографии.
На Союз русского народа возложили ответственность за три политических убийства — депутатов от Конституционно-демократической партии М. Я. Герценштейна и Г. Б. Иоллоса и «трудовика» А. Л. Караваева. М. Я. Герценштейн был убит в июле 1906 года на своей даче в Териоках, в Финляндии. Следствием было выявлено, что к убийству причастны члены Союза русского народа. Вскоре последовали обвинения руководства Союза и непосредственно А. И. Дубровина в организации этого убийства, подкрепленные свидетельствами со стороны бывших членов Союза, имевших личную неприязнь к Дубровину.[25] А. И. Дубровин после теракта лично принимал доклад и приветствовал убийц Герценштейна[26]. В марте 1907 года был застрелен Г. Б. Иоллос, редактор «Русских ведомостей» и друг Герценштейна.[27] Вскоре выяснилось, что он был убит революционером Федоровым, которого обманул член СРН Казанцев, выдававший себя за эсэра-максималиста, а Иоллоса — за предателя.[28] Казанцев был непосредственным убийцей Герценштейна и организатором покушения на С. Ю. Витте. «Союзникам» также было приписано убийство бывшего депутата от трудовой фракции А. Л. Караваева. В эмиграции Н. Е. Марков признал ответственность Союза за убийства Герценштейна, Иоллоса и Караваева.[29]